Hmmm... ich würde folgendes versuchen:
1) Die Partition mit dem Festplattendienstprogramm von OS X in FAT formatieren
2) per gedrückter Wahltaste beim Systemstart von der Windows-DVD starten
3) die Partition mit NTFS neu formatieren (NICHT löschen, sonst gibt es Ärger!)
4) Windows normal installieren
5) zuletzt von der MacOS-DVD die Windows-Treiber nachinstallieren.
So kann man z.B. Windows auf Rechnern mit mehr als zwei Partitionen erstellen, der Bootcamp-Assistent von 10.6 frisst nur Platten, die im Auslieferungszustand sind, d.h. eine Partition haben und wo dann eine zweite für Win erstellt wird.
Steigerungsfähig ist der Spaß, wenn man einen speziellen Win-Datenträger mit eingeschränktem Setup hat, wie z.B. die XP-Studentenlizenzen der TU Wien seinerzeit. Die können keine vorhandenen Partitionen neu formatieren, eine unter MacOS erstellte FAT-Partition ist aber für XP nicht bootfähig. Daher muss man erst einmal mit FreeDOS o.ä. die Partition formatieren.