Ich finde diese Trennung sehr sinnvoll. Denn alles was es im iTunes Store zu laden gibt - Musik, Fernsehsendungen, Filme, Podcasts und Apps - sind ausnahmslos Inhalte, die sich auf das iPhone bzw. das iPad laden lassen.
Mac Apps im Store wären also die ersten Inhalte im Store, die nichts mit dem iPhone zu tun haben. Und der iTunes Store ist meiner Meinung nach schon unübersichtlich genug. Mac Apps würden dort doch nur Verwirrung stiften. Sofort kämen fragen wie "warum läuft diese App nicht auf dem Mac" oder umgekehrt. Der Umstand, dass es Apps speziell fürs iPhone und nicht für das iPad und umgekehrt gibt, macht es schon verwirrend genug. Aber hier ist es für Entwickler zumindest technisch möglich eine App für beide Geräte zu programmieren, während Mac Apps schon aus technischen Gründen ganz anders sind.
Es macht schon Sinn das zu trennen. Und ich denke der App Store wird an Funktionalität über die Jahre hinweg auch noch wachsen. Es gibt noch so viele Dinge die Apple da hinzufügen kann, Upgrades, Deinstallation von Apps, Dashboard Widgets, Plugins oder Erweiterungen für bestehende Programme usw. Und das werden sie sicher auch noch erweitern, das ist jetzt eben die erste Version, bestehend aus der Grundfunktion: Mac Apps kaufen und installieren.
.