Ich ...
... würde kein RAID 0 als Systemfestplatte benutzen, sowie Daten vom System und Programmen sauber trennen.
Zum RAID 0: Der Geschwindigkeitszuwachs ist nur beim Booten spürbar, für Cache und andere Zugriffe bringt das nicht viel - aber es laufen immer zwei Festplatten. Wenn Du richtig Geschwindigkeit willst (und das allein für Cache Zugriffe, Booten ist eigentlich nebensächlich), nimmst Du dafür eine SSD. Ich würde grundsätzlich jedwedes RAID nur einsetzen, wenn es wirklich notwendig ist, also kritische Daten auf einem Server redundant vorgehalten werden müssen. RAID betreibt man am besten mit entsprechend aufbereiteten Festplatten, wie z.B. der Western Digital RE3 Serie, die die Redundanz des RAID Verbundes verbessern helfen im Vergleich zu den normalen Festplatten.
Ich würde auch immer eine eigene Systemfestplatte einrichten, auf der OSX und alle Programme installiert sind. Meistens braucht man dafür nicht viel Platz, d.h. man kann eine schnelle Festplatte wie etwa die Samsung F1 etc. partitionieren und die erste Partition für das System einrichten. Das gibt einen kleinen Geschwindigkeitsbonus. Die zweite wäre ein "weiches" Backup, für immer wieder gebrauchte Installationen und Daten, auf die man jedoch im Alltagsbetrieb nicht zugreift. Die schnelle erste Partition gibt ausreichend Performanz für das System.
Daten würde ich immer auf separaten Laufwerken haben, Backups meinetwegen immer extern - wobei ich ein externes Clone-Backup des Systems und der Daten für sinnvoll erachte. Timemachine kann besser intern bleiben, da je in der Standardeinstellung stündlich gesichert wird - eine externe Festplatte wäre dabei immer an.
Meine Einteilung als Beispiel:
a) intern
1. 500GB HD, partitioniert in 200GB für System/Programme und 300GB für den Ordner "Installationen" sowie eine erste Sicherung meiner Logic-Daten
2. 500GB HD: Time-Machine Festplatte, Musik
3. 500GB HD: Daten
4. 750GB HD: 1:1 Kopie der Systempartition, Daten
5. 1TB HD: Daten
6. 1TB HD: Videodateien
extern
1. 200GB: 1:1 Kopie des Systems
2. 1TB HD: wichtige Daten