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Du kannst doch z.B. im Finder deine Dateien, die du hochladen willst, komplett markieren und dann bei Cyberduck in das entsprechende Verzeichnis von deinem Webspace einfach rüberziehen.
Ansonsten probier doch mal, wie in einigen anderen Posts schon vorgeschlagen, Fugu aus. Da hast du auf der linken Seite dein lokales Verzeichnis und rechts den Webserver. Ist aber im Prinzip dasselbe.