Das ganze klingt doch sehr stark nach einem Hardwareproblem. Festplatte können wir ja jetzt schon ausschließen, ebenso wie scheinbar Arbeitsspeicher. Ich denke, das Logicboard hat nen Schuss weg, vielleicht Chipsatz oder irgendwas anderes.
Prüf doch mal mit der Hand nach einem Absturz die Temperatur des Prozessors und der einzelnen Chips auf dem Logicbard. Mach auch einen visuellen Test nach geplatzten Kondensatoren, lockeren Kabelverbindungen (speziell Netzteil <-> Logicboard) und tausch mal das IDE-Kabel aus. Viele Fehler entstehen nicht durch eine defekte Festplatte, sondern ein defektes IDE-Kabel.
Und was ganz wichtig ist: Starte den Rechner mit der Minimalausstattung: Alle RAM-Riegel bis auf einen einzigen ausbauen, nur ein IDE-Kanal (ergo das Kabel welches zum CD-ROM geht am Logicboard einfach abklemmen), alle evtl. vorhandenen PCI-Karten ausbauen und alle externen Geräte wie Firewire-Platten oder sonstiges abschließen.
PS: Auch wenn du meinst du könntest RAM ausschließen, ich hab nirgendwo lesen können, dass du den Rechner mal separat mit jedem verfügbaren RAM-Modul betrieben hast sondern nur den neuen Riegel ausgebaut hast. Was ist jedoch, wenn der alte Riegel einen Schaden hat? Für obigen Minimaltest wäre es am besten, wenn du dir ein RAM-Modul von einem Freund ausleihst bei dem du zu 100000% davon ausgehen kannst, dass es nicht defekt ist. Denn eine 99.9999%ige Sicherheit reicht in dem Fall nicht.