Die Schicht ist Wärmeleitpaste, und die gehört auf jeden Fall zwischen Prozessor und Kühlkörper. Da genügt eine hauchdünne Schicht. Die solltest du auf jeden Fall erneuern, wenn der Kühlkörper wieder auf den Prozessor kommt. Ohne WLP ist der Prozzi ganz schnell tot. Die Oberflächen von Prozessor und Kühlkörper sind nicht ganz plan, die WLP gleicht das aus und hilft so, die Abwärme des Prozessors an den Kühlkörper zu leiten.Wichtig ist, nur eine ganz hauchdünne Schicht aufzutragen, wenn es zuviel ist, dann wird das überschüssige Material an den Seiten wieder herausgedrückt. WLP leitet, das kann dann zu einem Kurzschluss führen.
Also beide Seiten gut abwischen und dann hauchdünn die WLP auf dem Prozessorkern auftragen.
Hast Du inzwischen mal das Board genauer angeschaut, ob was zu sehen ist, wo es geraucht hat?
MacZappi