Apples X11.app hat definitiv kein Equivalent zur XF86config. Dass XDarwin sowas nicht hat wundert mich, kann ich aber im Moment nicht nachschauen. Einstellungen für Apples X11 können mit defaults read com.apple.x11 ausgelesen werden, ich weiß aber nicht ob es da noch viel anderes gibt, was man einstellen könnte. Probleme mit der Tastatur (so sie grundsätzlich geht) können eventuell zur Laufzeit mit xmodmap behoben werden.