Alle persönlichen und beruflichen Dateien packst du am besten in deiner User-Ordner "MacEnroe". Darin kannst du dich nach Herzenslust austoben wie unter 9, verschieben, umbenennen, löschen wie es dir grad gefällt.
In den Ordner Programme (nicht verschieben!) packst du – logisch – alle Programme. Hier am besten (um spätere Updates nicht zu behindern) nichts umbenennen.
Aus den Ordnern Library und System der oberen Hierarchie-Ebene am besten ganz die Finger lassen. Also: Dort nichts anrühren, verschieben, umbenennen und löschen. Dann funktioniert X am besten.
Nachtrag: Auch in deinem User-Ordner befindet sich ein Ordner "Library". Er enthält Preferences usw. Auch hier solltest du möglichst nichts ändern, außer du kennst dich schon ein bisschen besser aus. Prefs kann man bei Programm-Problemen übrigens wie unter Mac OS 9 löschen. Erkennbar sind sie am Suffix .plist.