Unter OSX sollte man generell nur eine Partition pro Platte anlegen. Da hilft nur sich eine gescheite Ordnerstruktur anzulegen, um die Übersicht zu behalten.
Sollte es um Datensicherheit im Falle eines Systemcrashs drehen, kann man nur sagen, daß unter OSX eine Vorsicht, wie unter Windows nicht nötig ist, da man hier auch bei einer Neuinstallation nicht zwingend die vorhandenen Daten zerstören muß. Bei Win würde ich gerade deshalb auch heute noch generell mehrere Partitionen empfehlen.
Zu Backupzwecken und aus Gründen der Datensicherheit ist eine einzelne Festplatte sowieso die schlechteste Wahl. Hier ist es eher sinnvoll regelmäßige Backups auf einer zweiten Festplatte zu machen.
Was OS9 angeht: Wenn Dein Mac sowieso nicht unter Classic booten kann, ist es auch unnötig dieses auf eine zweite Partition oder Festplatte auszulagern. Es kann problemlos auf der selben Partition wie OSX installiert werden. Eine zweite Partition bringt auch hierbei keinerlei Vorteile.