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Habe nun alles mal probiert! Perian deinstalliert und nur A52, alle Codec gelöscht und neu installiert. Klappt leider immernoch nicht, ich leg mich erstmal schlafen. Zur Not muss ich halt mit einem anderen Player die Sachen anschauen.
Im Bugtracker hatte noch jemand das gleich Problem. Auch mit einem MacMini. Vielleicht liegt es ja an der Kombination Mini & Perian?