Naja, das Thunderbolt kann man nicht an den Ausgang der GPU anschließen...
[OT]Aus diesem Grund kauft man sowas auch nicht.[/OT]
Ich nutze selbst keine eGPU, daher sind meine Infos ggf. nicht aktuell, aber du solltest (zumindest in unterstützten Apps) im Info-Fenster "Externe GPU bevorzugen" oder sowas finden. Dann sollte das Programm die eGPU nutzen, auch wenn es auf einem Display läuft, das nicht direkt an die GPU angeschlossen ist.