Mac OS X-Software für Biologen

  1. Wuddel

    Wuddel Thread StarterMacUser Mitglied

    Mitglied seit:
    26.05.2002
    Beiträge:
    3.760
    Zustimmungen:
    2
    Hallo,

    ich starte mal einen Thread für "uns" (keine Ahnung ob es noch andere gibt). Ich suche momentan zwei Programme. Eins fürs multiple sequence alignment (evtl. mit Clustal W-Algorithmus) und eins für die Erstellung phylogenetischer Bäume (es sollte am besten die Daten des ersten Programms importieren können.)

    Ein Tipp von mir: Statt rasmol verwende ich pymol. Sehr schön. Einfaches nicht lineares curve-fitting mit Marquardt-Levenberg-Algorithmus mache ich mit gnuplot. Beides lässt sich mit fink installieren.
     
    Wuddel, 17.11.2003
  2. Woulion

    WoulionMacUser Mitglied

    Mitglied seit:
    06.06.2002
    Beiträge:
    1.310
    Zustimmungen:
    0
    Hi

    Ja, es gibt noch mehr Biologen hier. Ich werde mal einen Kollegen auf den Thread aufmerksam machen, der steckt da tiefer drin. Gleichwohl, der Hausstandard heisst MacVector, für den Rest (Windows-User) Lasergene und VectorNTI, GCG via HUSAR am EMBL und über den Einsatz von EMBOSS denken wir ernsthaft nach. Ich habe mal JEMBOSS-Server auf einem Linux-Cluster gesehen, sehr beeindruckend.

    So weit

    HTH

    W
     
    Woulion, 18.11.2003
  3. Wuddel

    Wuddel Thread StarterMacUser Mitglied

    Mitglied seit:
    26.05.2002
    Beiträge:
    3.760
    Zustimmungen:
    2
    BTW EMBOSS. Ich hab es auch mal per Fink installiert. Die Kommandozeileprogramme funktionieren auch. Allerdings kann ich Jemboss (der Java-Interface) nicht dazu bewegen die lokal installierten Programme zu verwenden. Es will immer auf einen Remote-Server.

    MacVector liegt mit 2500 EUR nicht in der Kampfklasse eines Studenten/Diplomanden.
     
    Wuddel, 18.11.2003
  4. thomsen

    thomsenMacUser Mitglied

    Mitglied seit:
    13.11.2003
    Beiträge:
    166
    Zustimmungen:
    0
    hi zusammen,

    kennt jemand auch gute freeware für plasmid-mapping, sequenz-analysen, primer-design, etc. brauche das zeugs für meine dipl. arbeit, wen ich nichts brauchbares finde, dann muss ich meine auswertungen und arbeiten auf der firmen-dose erledigen, was ich jedoch nicht unbedingt will.. :-(
     
    thomsen, 26.10.2004
Die Seite wird geladen...
Ähnliche Themen - Mac Software Biologen
  1. DoomDom
    Antworten:
    2
    Aufrufe:
    177
    DoomDom
    30.09.2016
  2. anfaengerulli

    OCR Software für mac

    anfaengerulli, 14.03.2015, im Forum: Andere
    Antworten:
    11
    Aufrufe:
    1.343
    anfaengerulli
    20.03.2015
  3. ghostroot
    Antworten:
    4
    Aufrufe:
    509
    CatcheR
    22.12.2014
  4. eve0
    Antworten:
    10
    Aufrufe:
    1.681
    Mankind75
    11.12.2015
  5. Grenzgaenger
    Antworten:
    0
    Aufrufe:
    1.249
    Grenzgaenger
    18.02.2014