Du kannst die Suchfunktion im Browser nutzen und alle nicht verwendeten Medien anzeigen lassen. Über "Offline erstellen" kannst du die dann auch von der PLatte löschen und danach die Offlineclips aus dem Projekt entfernen. Oder aber den Medienmanager verwenden und das Projekt mit den verwendeten Clips an einem zweiten Ort abspeichern. Die Originaldateien kannst du danach löschen.
Oder aber: Die Dateien, bei denen du meinst du brauchst sie nicht mehr, in einen anderen Ordner verschieben (im Finder!). Die gehen dann in FCP offline - aber du erkennst ja dann, ob es Dateien sind, die du noch brauchst oder nicht bzw die in der Sequenz verwendet wurden. Zur Not dann neu verbinden bzw. zurück schieben im Finder und das Projekt neu öffnen, dann sind auch alle wieder online (zwischendurch natürlich das Projekt NICHT abspeichern!)