Google brachte folgende Lösung:
"Ein mitarbeiter von Apple hat mir empfohlen jeden Film in eine eigene Playlist in iTunes abzulegen. Wenn man die Filme alle auf die AppleTV gesynct hat kann man auf manuelle Synchronisation umschalten und alle Playlists mit Filmen deselecten. So kann man die Filme auf dem Rechner löschen ohne, dass sie beim nächsten sync auf der AppleTV gelöscht werden." Zitat Ende