Eine Textmarke ist eine Verlinkung besonderer Art.
Und diese Verlinkung findet ihre Quelle (hier also diejeniege in der Zitatedatenbasis in Endnote), aus welchem Grund auch immer, nicht.
Darum meine Rückfrage, ob denn das Endnote-Addin im Word-Dokument aktiv ist.
Ich würde (allerdings in Unkenntnis dieser Zitieranwendung) erwarten, dass Endnote so funktioniert, dass die Zitate in Endnote bzw. einer von Endnote verwalteten Datei gespeichert werden; wobei das Endnote-Addin für Word dafür sorgt, dass die Zitationen ins Word-Dokument gelangen. Das geschieht offenbar als Textmarken. An der Struktur jener Textmarken darf dann aber in (bzw. durch) Word nichts verändert werden.
Nun schreibst du, dass du »gerade dabei [warst,] über Endnote X7 die erste Zitation [im] Dokument einzugeben«. Du »gibst« aber im Dokumenttext keine Zitate ein, sondern nur deren Textmarke (die wiederum durch Endnote erzeugt wird). Die Zitate – so erwarte ich – würden im Zitatemanager der jeweiligen Zitateanwendung (hier also Endnote) eingegeben.
So also auch die neue Rückfrage, was du wann in welcher Reihenfolge tust, und auch, was du mit »eingeben« meinst.
Antworten auf die Rückfragen mag Nutzern von Endnote helfen, die Ursache deines Problems einzugrenzen.