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FAT ist eines der veraltetesten Dateisysteme, HFS eines der modernsten. FAT und HFS unterscheiden sich deutlich in der Struktur. FAT verwendet eine einfache Tabelle, HFS und HFS+ eine B-Tree-Struktur.
FAT kann eigentlich keine Dateinamen, die länger als 8.3 Zeichen sind (die langen Dateinamen sind Zusatzinformationen). FAT kennt keine Metainformationen (abgesehen von Name und Datum) und keine Zweige.
Vorteil von HFS und HFS+: unterstützt Dateien größer 4 GB.
Ein wichtiges Argument bei Audio- und Videobearbeitung.
Außerdem ist die Geschwindigkeit beim Zugriff von OSX auf FAT nicht so hervorragend...
Linux unterstützt HFS+ mit diesem Treiber, aber Achtung, erst ab Kernel 2.6 kann es auch mit großen Dateien (> 4 GB) umgehen.