Versuche mal das Programm SFirm von der Sparkasse. Unterstützt jede mir bekannte Bank in D, bietet Zugang über HBCI (mit Karte, Stick, Diskette etc.), FTAM, Pin/Tan. Kostet aber. Die Banken in Ö sollten zumindest einen Zugang über FTAM anbieten, der ist international Standard, kostet aber bei einigen Banken auch extra. Ach ja, SFirm läuft nur auf Windows.
Ich benutze das beruflich und verwalte ca. 70 Konten bei verschiedenen Instituten darüber und kann es empfehlen.
edit: Rechtschreibung