Wenn das NAS bei dir zu Hause steht und du "nur" mit Macs darauf zugreifen willst, dann solltest du mit AFP arbeiten (vorausgesetzt der Hersteller hat eine Bug-Freie Umsetzung implementiert).
Sollten auch Windows-Rechner mit angebunden werden, würde ich stattdessen mit SMB arbeiten.
NFS wäre noch eine Alternative zu AFP und auch für andere Unixe geeignet. Für Windows weniger, da zusätzliche Installation der NFS-Unterstützung für Windows erforderlich.
FTP ist hautpsächlich für den Internet-Datenaustausch und generell eigentlich heutzutage nicht mehr zu empfehlen.