Naja... Woher willst du wissen, dass iNyx sich nichts eingefangen hat.
Der Malwarebytes-schutz ist - da auch nervige PUPse erkannt werden - umfassender als der rein auf Sicherheitsbedrohungen ausgelegte Schutz von Apple.
Und der Virenscanner will natürlich (und zu recht) überall Prüfen...
Das neue macOS System sagt du darfst erst nach Bestätigung überall Püfen.
Wenn du das nicht zulässt kann der malwarebytes an den neuralgischen Punkten nicht nachschauen und kann seine Funktion nicht erfüllen.
Letzlich ist Malwarebytes ein On-Demand Scanner der sich nicht tief in das System eingräbt (aber eben tief reinschauen möchte.)
-> Zulassen, Prüfen lassen und (je nach bequemlichkeit) danach die Rechte wieder entziehen.
Ich selbst habe dem "Schutz durch Malwarebytes" dauerhaften "Vollen Festplattenzugriff" eingeräumt. Starte das Programm aber nur sehr Sporadisch.