Ich vermute, dass die SSDs nur in einem M.2-Steckplatz direkt auf dem Mainboard gut (bzw. wie beworben) funktionieren. Wahrscheinlich ist die Energieversorgung/Lastspitzen bei den Gehäusen problematisch, obwohl M.2 für irgendwas unter 10W spezifiziert ist und TB3 das im kleinsten PD-Mode liefern kann (5V bei 2A, macht 10W).
Nicht ohne Grund sind bei den Fertiglösungen keine Serien-SSDs, sondern solche mit gesonderter Firmware. Daher wäre das mein Rat, weil man sowas relativ einfach testen und ggf. zurückgeben kann.