Nabend zusammen,
also ich habe das Problem seit neuesten auch gehabt, und zwar nach dem switch von meinem alten iBook auf mein neues MacBookPro!
Vorher lief alles unproblematisch, Mails die ich einmal als gelesen markiert habe, blieben gelesen, dann auf dem neuen Book Pustekuchen, TIPPS wie unter "Accounts/ IMAP Account/ Erweitert" das "Geänderte Postfächer automatsich synchronisieren" brachte keinen Erfolg.
Nach langem suchen und probieren, dann doch eine Lösung:
Für alle die PGP für Mail benutzen, es liegt daran!
Ich selber benutze OS X Tiger 10.4.10 mit Mail 2.1.1 und PGP 1.1.2.
Man muss unter "Einstellungen/ PGP /Ansicht" die Haken "Nur ungelesene" unter "Nachrichten automatisch authenifizieren" und unter "Nachrichten automatisch entschlüsseln" wegnehmen, danach trat das Problem bei mir nicht mehr auf!
Und da diese Einstellungen nur für die Ansicht waren und sich keinerlei Nachteile beim normalen Betrieb ergaben kann ich damit gut leben.
Es hat lange gedauert bis ich das raus hatte, weiß auch immernoch nicht warum das dann auf meinem iBook ohne Probleme funktionierte.
Ich hoffe ich kann damit noch einigen behilflich sein.
Gruß
DocC