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CTO steht für »Configure-to-Order«. Du stellst also die Konfiguration (Festplatte, Speicher, etc.) selber zusammen und bekommst dann dein »maßgeschneidertes« iBook zugesandt.
Edit: Bei cyberport gibt´s übrigens auch eins für 799, allerdings mit 10.3 statt 10.4 ausgestattet. link